手足口病鉴别
根据临床特征，在大规模流行时，诊断不困难，但散在发生时，须与下列疾病相鉴别：
(1)与疱疹性口炎相鉴别
四季均可发病，以散在为主。一般无皮疹，偶尔在下腹部可出现疱疹。起病时可有38℃-40℃的发热;1-2天后口腔黏膜上出现小水疱，可为单个，也可成簇;小水疱破溃后形成很浅的溃疡，上面有黄白色膜样渗出物，周围有红晕;患儿常有局部疼痛伴流涎，烦躁哭闹、拒食吐奶等表现，通常1到2周即可消退。
高发群体
疱疹性口炎是Ⅰ型单纯疱疹病毒引起的急性感染，以6个月到2岁的婴幼儿最易患病。
若不经治疗，经过l-2周会自愈，但容易复发，如果宝宝反复发作，通常与微量元素锌的缺乏有关。
高发季节
疱疹性口炎终年可以发生，冬季为流行高峰，且具传染性，可在幼儿园等群体发病。
(2)与口蹄疫相鉴别
口蹄疫的病原体为口蹄疫病毒，属于人畜共患病原体。手足口病是由数种肠道病毒感染所致。口蹄疫病毒只引起偶蹄类动物牛、羊、猪、鹿、骆驼等发生口蹄疫，成为人患口蹄疫的传染源。只有先出现兽疫，才有可能使人患病。口蹄疫是通过接触病畜口腔、蹄冠部的溃疡烂斑，经皮肤粘膜感染的;偶而也有食用了被病毒传染而又未加热(巴氏消毒)的奶感染的。因此，人患口蹄疫是极为散在发生的。手足口病是由于接触病人，通过日常生活用品、食具、玩具的污染经口感染的，也可通过呼吸道传播。口蹄疫、手足口病虽患病部位在口腔、手指间、足趾端有相似之处，但症状体征各有不同。
口蹄疫起病后主要表现为全身中毒症状和局部疱疹损害两大特征。出现发热、头痛、全身不适，1~2天后在口腔粘膜、舌边、手指间、足趾端发生水疱，再1~2天水泡破溃，形成烂斑，继发感染成脓疱，然后结痂、脱落，一般不留瘢痕。手足口病大多无发热或低热，但有呼吸道感染症状。先在口腔粘腊出现疱疹，分布和颊粘膜、齿龈、舌边，并破溃成溃疡。随即在手指、足部、臀部、膝部出现丘疹，第二天只有少部分丘疹形成疱疹，如绿豆、赤小豆大，单个性不融合，内含透明液体，终不破溃，3~5天自行吸收收缩。
(3)疱疹性咽颊炎
可由CoxA组病毒引起，病变在口腔后部;如咽前柱、扁桃体、软腭、悬雍垂，很少累及颊粘膜、舌、龈。可通过检测EV71确诊。
(4)水痘与手足口病之五大鉴别
小儿手足口病的发病与水痘类似，皮疹也有相似之处，有时容易混淆不清。两者之间还是具有很多不同点，鉴别如下：
易感人群的区别：手足口病的患儿，通常以3岁以下的宝宝最为多见，其次是3-5岁的宝宝;而水痘患儿1-6岁均可多见。
病原体的区别：手足口病是由肠道病中的柯萨奇16病毒引发，好发于每年的4-5月，6-7月份是发病的最高峰，8月份开始下降，9月份以后就很少见了，因此小儿手足口病的发病很有季节性;而水痘是由水痘病毒引起的一种急性传染病，主要发病季节是在冬春，夏季较少见。
皮疹的区别：小儿手足口病患儿的皮疹主要出现在口腔黏膜、手和脚部，尤其是口腔黏膜多数都出疹子，同时伴发口炎或口腔溃疡的也较多;而水痘的皮疹呈向心性分布，即躯干处较多，四肢、头面部少，手心、脚心及口腔黏膜上的疹子更是少见。
有无免疫力的区别：小儿手足口病患病痊愈后，不会获得免疫力;而婴幼儿患过一次水痘，病愈后即可获得永久性的免疫。
其他区别：正在使用激素的宝宝与小儿手足口病的患儿接触，不会病情加重;而与水痘患儿接触，则会使他们的病情很快加剧。
(5)与其他病毒所致脑炎或脑膜炎相鉴别
临床表现与手口足病合并中枢神经系统损害的重症病例表现相似;
(6)与脊髓灰质炎相鉴别
主要表现为双峰热，病程第二周退热前或退热过程中出现弛缓性瘫痪，无皮疹;
(7)与肺炎相鉴别
表现为发热，咳嗽，呼吸急促等呼吸道症状，一般无皮疹，无粉红色或血性泡沫痰;
(8)与暴发性心肌炎相鉴别
一般无皮疹，有严重的心律失常、心源性休克、阿斯综合征发作表现。
