隐睾症的病因可能与下列因素有关：
1．胚胎期牵引睾丸降入阴囊的索状引带退变或收缩障碍，睾丸不能由原位降入阴囊；
2．胚胎期精索血管发育迟缓或终止发育，造成睾丸下降不全；
3．先天性睾丸发育不全使睾丸对促性腺激素不敏感，失去下降的动力；
4．胎儿生长过程中母体缺乏足量的促性腺激素，影响睾酮的产生，影响睾丸下降的动力；
5．局部因素如机械性梗阻和腹膜粘连阻止睾丸正常下降。因内分泌因素所致的隐睾症多为双侧性；单侧性隐睾症往往与局部、机械因素有关。
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