人体的免疫系统对自身的蛋白组织具有耐受性，而对外来的蛋白组织没有耐受性，外来的蛋白组织比如病毒，细菌等，一旦进入了人体，免疫系统就会主动的攻击他们，直到将其清除，然而某些因素比如遗传,药物，营养障碍，以及一些尚不知道的因素，使人体自身的某些蛋白组织失去了免疫系统对其具备的耐受性，这部分蛋白组织便会受到免疫系统的攻击，并产生损伤，这样称为自身免疫损伤或自身免疫病，自身免疫性肝炎就是这样发生的，简单的说就是自身的免疫系统去攻击或者残害自身的肝脏，使肝脏发生了炎性病变。
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