生殖器泡疹的治疗是按照生殖器疱疹的症状而选择不同的治疗方式。若无症状或亚临床单纯性的泡疹病毒感染一般是无需药物治疗，有症状的治疗，主要是系统性的抗病毒治疗和治疗合并感染的相关症状等等，并且根据患者的实际情况，选择辅助的心理用药。药物治疗主要包括一、系统性抗病毒治疗，常用药物有阿昔洛韦、泛阿昔洛韦、伐昔洛韦，一般口服7-10天。局部的处理，皮疹局部可采用生理盐水或百分之三的硼酸溶液进行清洗。剧烈疼痛的，可采用相对的治疗措施减轻症状。反复复发的，可采用长期一致的疗法，如口服阿昔洛韦等等，需要长期服药。
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