真菌性包皮龟头炎的病因很明确，是真菌感染引起的，所以主要是采取积极抗真菌治疗。抗真菌的治疗药物分为外用和内服的，真菌性龟头炎的男性患者，一方面可以外用克霉唑乳膏或者硝酸咪康唑乳膏进行治疗，清洗患处后涂抹适量，一天2-3次，能够抑制局部的真菌繁殖。另一方面还需要口服抗真菌的药物，如伊曲康唑、氟康唑等，这些药物属于处方药，一定严格按照医嘱使用。抗真菌药物的口服治疗需要时间比较长一些，要结合病史来明确治疗疗程，特别是反复发作的或者迁延不愈的真菌感染患者，口服药物治疗可能需要3-6个月，使用抗真菌药物的过程中，需要定期进行肝功能和肾功能的监测，防止药物继发肝肾功能损害。在治疗过程中，禁止性生活，防止感染女性。如果女性患有真菌性阴道炎，此时需要积极抗真菌治疗，防止夫妻之间的交叉性感染。
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